Очень волшебная технология, но как ко всему новому к ней нужно привыкнуть. Я помню как пришлось поиграться с якорями и растягиваниями, чтоб понять как они работают и как из них лепить интерфейс в iOS, помню как разбирался в выравниваниях в Qt. А вот как с выравниваниями разбирался в Delphi очень давно - уже не помню, но обязательно разбирался :-)

Я приверженец максимально возможную часть, связанную с UI, выносить в  xib (или StoryBoard), поэтому поковырялся с автовыравниванием и вроде все хорошо с ним. Но это были не сложные и не очень комплексные интерфейсы.
Вот тут нашел очень хороший учебник, который поможет разобраться с этой темой. Забавно и наглядно.